落叶乔木，高达11米，胸径达30厘米，树皮灰白色，平滑。嫩枝绿色，无毛，老枝紫色，疏生皮孔；芽狭卵形，顶端稍弯，被长绢毛。叶膜质，倒卵状长圆形或长圆形，长7-16厘米，宽3-7厘米，先端宽圆具渐尖头，基部阔楔形或圆钝，上面绿色，无毛，下面淡绿色，中脉及侧脉有长弯曲毛，侧脉每边8-10条；叶柄长0.6-1.8厘米，初被长柔毛，托叶痕长为叶柄长的1/5-1/2。花蕾卵形，花先叶开放，有芳香，直径约12厘米；花梗长2-4毫米，密被长毛；花被片9，近匙形，先端圆或稍尖，长6.8-7.8厘米，宽2.7-3.8厘米，内轮较狭小，白色，背面中部以下淡紫红色，上部白色；雄蕊长约11毫米，花药长约7毫米，两药室分开，内侧向开裂，药隔伸出成短尖，花丝紫色，长约4毫米；雌蕊群圆柱形，长约2厘米，心皮长约4毫米，花柱长约1毫米。聚合果圆柱形，长5-7厘米；成熟蓇葖近圆形，有疣点状凸起，顶端钝圆。花期3-4月，果期8-9月。宝华木兰早期生长较快，成年树生长缓慢。实生树7-9年开花，嫁接树当年开花。

物种产地年平均温度16℃，7月平均最高温度32℃，冬季低温通常-6至-8℃，极端最低温约-14℃，年降水量约900毫米。土壤为沙壤土，呈酸性反应。宝华玉兰只长在宝华山北坡，海拔必须是220米左右，离开这个环境就很难生存。零星生长在常绿、落叶阔叶混交林中，伴生植物主要有野核桃、枫香、榔榆、黄连木，或混生少量青冈和紫楠。

宝华玉兰全球只剩下38棵了，濒危种。宝华木兰在原产地江苏省宝华山仅残留18株，最大者高11米，胸径45厘米，散生于稀疏的阔叶林中,全部存活在江苏镇江市的宝华山上。由于林下灌木层不断地坡坏，未见更新苗木。若不采取保护措施，将有绝灭的危险。由于宝华玉兰繁殖全靠自然繁殖，没有人工的栽培介入，这也让宝华玉兰的存活量少得惊人。处在自然繁殖情况下的宝华玉兰，在生长早期会成长得很快，但当树龄到了成年之后，生长速度便开始放缓，要等10年左右才能开花结果，如此成长艰难的树木当然难逃绝种的境界

本种仅分布在江苏南部一小块土地上，与其近缘种类区别明显，对于研究木兰属的分类系统有一定的意义。树干挺拔，花大而艳丽，芳香，是珍贵的园林观赏树木。

宝华玉兰自然分布于江苏省句容市境内的宝华山。为了保护珍贵稀少的宝华玉兰，1984年建立了面积为34平方千米的江苏省句容宝华山自然保护区，1996年改建为国家级森林公园。这里地处宁镇山脉中段，山体东西走向，海拔437.2米，峰低坡缓，为亚热带和暖温带的过渡地带，属北亚热带季风气候，四季分明，气候温和，雨水充沛，日照充足。年平均降水量为1018.6毫米，年平均气温15.4℃，年平均日照时数2116小时，年平均无霜期229天。土壤微酸性，土层较厚，为棕色土壤。该区植物的森林群落类型主要有常绿阔叶林，落叶-常绿阔叶混交林，落叶阔叶林及由人工林演替而来的竹阔混交林、落叶阔叶-油茶混交林等。该种的成年植株主要分布于宝华山国家森林公园内的锅底洼（黄泥塘下方）、将军洞和小山头。文献记载，在隆昌寺附近曾有零星分布的宝华玉兰，调查中没有发现。宝华玉兰在锅底洼分布相对较多，树高超过10米，最大树龄超过一百年，植株能开花结实，常与毛竹、紫楠、野核桃、枫香等伴生，但但林下岩石裸露，未见宝华玉兰的幼苗。将军洞上方的宝华玉兰为10年前人工栽种，随后不断有毛竹和枫香、黄连木、红枝柴等阔叶树种侵入。如今，这里最粗的宝华玉兰胸径达8厘米，少量植株已经开花结果。林下未见实生苗，但有少量的萌生苗。由于靠近公路和竹楼景区，人为干扰较大，有些宝华玉兰甚至遭到砍伐。截止到2013年10月25日宝华玉兰，在人工精心捉种、培育下，已有苗木数万棵

用种子繁殖。外种皮富含油质，采收后宜加除去，种子用轻微湿润的河沙层积贮藏。春播后约30-40天发芽。也可用2-3年生白玉兰Magnolia denudata Desr.实生苗作砧木，于早春采集宝华玉兰的枝条嫁接育苗，便愈合成活率可达70-80%。本种适应性广，栽培容易。

本种叶倒卵状长圆形，花被片匙形，外面中部以下紫色等特征与近缘种白玉兰有明显区别。本种花直径12厘米，芳香艳丽，为优美的庭圆观赏树种。 树干呈灰色或淡灰色，手感平滑。花开放的时候非常香，能顺风飘出好远。花瓣有9片，像汤匙，不同单株花色还有变化，花中部以下是紫红色，中部则是淡紫红色，而到了上部就是白色，长有7－8厘米。因为对土壤和气候非常挑剔，宝华玉兰种仅分布在句容这一小块土地上，与和它有‘血缘关系’的其他玉兰区别明显，对研究木兰属的分类有一定的意义，树干挺拔，是非常珍贵的园林观赏树木。